В рамках навчання на програмах з природничих наук можна глибоко зануритися у вивчення будь-якої області, спостерігати і вивчати природні явища. Навчання може включати в себе курси з астрономії, біології, фізики, екології та хімії.

Є кілька установ для вищих навчальних розташованих по всій Пуерто-Ріко, з Університет Пуерто-Ріко є найстарішим і найбільшим. У території Сполучених Штатів, громадяни можуть мати доступ до додаткових можливостей для освіти.

Докторський ступінь або PhD, може вимагати восьми або більше років навчання і написання дисертації. У більшості областей, володіння докторським ступенем дає право стати професором в обраній області. Доступно безліч різних програм докторантури.